More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2028 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2028  OmpA family protein  100 
 
 		 1338 aa  2697    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00257067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1987 aa  73.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 490 aa  72  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 374 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  32.58 
 
 		 215 aa  70.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  33.96 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.23 
 
 		 224 aa  67.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 225 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.99 
 
 		 458 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 193 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.56 
 
 		 440 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  31.48 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 		 236 aa  66.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  35.35 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.42 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  30.48 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0664  OmpA family protein  35.48 
 
 		 422 aa  64.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 229 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  32.31 
 
 		 229 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  30.08 
 
 		 218 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.19 
 
 		 670 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  28.79 
 
 		 236 aa  63.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  37.36 
 
 		 169 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  34.41 
 
 		 227 aa  63.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.46 
 
 		 321 aa  63.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.78 
 
 		 464 aa  63.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.48 
 
 		 175 aa  63.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 		 170 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  31.91 
 
 		 306 aa  63.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.13 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  63.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0889  peptidoglycan associated lipoprotein, putative  34.21 
 
 		 202 aa  63.2  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.831236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.9 
 
 		 168 aa  62.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 1755 aa  63.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  31.03 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  31.03 
 
 		 168 aa  62.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  31.03 
 
 		 168 aa  62.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 525 aa  62  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  29.46 
 
 		 223 aa  62  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 		 230 aa  62  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  28.79 
 
 		 220 aa  62  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 		 1264 aa  62  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  31.82 
 
 		 217 aa  62  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  28.79 
 
 		 221 aa  62  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  30.88 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 		 208 aa  61.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.08 
 
 		 1026 aa  61.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 215 aa  61.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.43 
 
 		 170 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  32 
 
 		 326 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.91 
 
 		 170 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.57 
 
 		 164 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 537 aa  61.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  29.77 
 
 		 225 aa  61.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.87 
 
 		 369 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 434 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0072  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.97 
 
 		 192 aa  61.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.524746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  30.47 
 
 		 221 aa  61.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.91 
 
 		 170 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0071  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  37.97 
 
 		 192 aa  61.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.87 
 
 		 188 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  32.06 
 
 		 263 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.58 
 
 		 370 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.52 
 
 		 310 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.48 
 
 		 200 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  30.52 
 
 		 445 aa  60.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  27.01 
 
 		 224 aa  60.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30 
 
 		 205 aa  60.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.52 
 
 		 310 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>