More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1986 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  100 
 
 
636 aa  1289    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  47.58 
 
 
864 aa  196  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  36.51 
 
 
593 aa  193  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  46.19 
 
 
859 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  43.05 
 
 
860 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
483 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  38.91 
 
 
696 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.62 
 
 
861 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.75 
 
 
500 aa  187  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  43.24 
 
 
911 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.08 
 
 
483 aa  185  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.27 
 
 
483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  44.14 
 
 
858 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.2 
 
 
585 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  41.55 
 
 
641 aa  179  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  44.08 
 
 
903 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  43.12 
 
 
696 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  38.49 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  32.26 
 
 
487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 
734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
284 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  39.92 
 
 
441 aa  163  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  38.58 
 
 
758 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  37.71 
 
 
759 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
746 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  40.17 
 
 
546 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  37 
 
 
760 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
702 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 
794 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.94 
 
 
529 aa  158  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  36.72 
 
 
744 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 
741 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.44 
 
 
764 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.43 
 
 
701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.79 
 
 
652 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.74 
 
 
701 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  32.73 
 
 
701 aa  154  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.81 
 
 
737 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  34.68 
 
 
358 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
479 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  41.63 
 
 
667 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 
645 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  37.44 
 
 
523 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.36 
 
 
753 aa  151  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
756 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  38.01 
 
 
752 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
540 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
540 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
540 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.12 
 
 
723 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.05 
 
 
656 aa  150  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.98 
 
 
657 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.89 
 
 
611 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  33.67 
 
 
567 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.67 
 
 
723 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  37.78 
 
 
488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
532 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  37.85 
 
 
729 aa  148  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.36 
 
 
936 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
536 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  39.19 
 
 
614 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 
712 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.8 
 
 
656 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.3 
 
 
672 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  30.98 
 
 
549 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  39.44 
 
 
526 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.24 
 
 
701 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  34.02 
 
 
536 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  38.91 
 
 
607 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
662 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.99 
 
 
524 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  38.26 
 
 
364 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  33.33 
 
 
494 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.83 
 
 
754 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.96 
 
 
703 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.04 
 
 
638 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  43.11 
 
 
591 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 
632 aa  144  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  36.65 
 
 
670 aa  144  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
735 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  38.03 
 
 
524 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
726 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.15 
 
 
662 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  36.87 
 
 
717 aa  143  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.84 
 
 
694 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  35.46 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.81 
 
 
650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.33 
 
 
658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  37.22 
 
 
725 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  37.5 
 
 
518 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 
641 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  31.91 
 
 
558 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  38.57 
 
 
536 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  37.91 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  35.11 
 
 
758 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>