197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1873 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  542  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  81.82 
 
 
286 aa  381  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  73.87 
 
 
292 aa  375  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  30.29 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  35.4 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  41.05 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  41.05 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  41.05 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  41.05 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  41.05 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  41.05 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  38.89 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  36.78 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  36.67 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  37.78 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  34.88 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  37.78 
 
 
226 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  38.71 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  36.17 
 
 
244 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  35.56 
 
 
225 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  35.56 
 
 
203 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  35 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  35.63 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  37.8 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.88 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  35.56 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  30.77 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  26.18 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  33.33 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  33 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.4 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  28.78 
 
 
237 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  32.11 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  34.91 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  34.04 
 
 
343 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  32.99 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  30.77 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  27.91 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  26.89 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  28.57 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  32.22 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  31.46 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  28.87 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  31.87 
 
 
193 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  35.64 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  33.68 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  27.73 
 
 
241 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  32.58 
 
 
337 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  29.52 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.95 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  25.33 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  31.37 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  34.29 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  35.23 
 
 
346 aa  52.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  31.39 
 
 
237 aa  52.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  27.67 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  32.58 
 
 
337 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.46 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  33 
 
 
237 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  32.58 
 
 
337 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  32.29 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  31.33 
 
 
234 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.46 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  36.14 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.95 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.82 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  29.89 
 
 
528 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  28.57 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000223923 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  31.52 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  31.87 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  28.46 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  34.62 
 
 
198 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  30.23 
 
 
480 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  31.25 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  28.41 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  36.59 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  31.11 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.82 
 
 
775 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  27 
 
 
215 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0074  Abortive infection protein  29.27 
 
 
316 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.460326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  32.32 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  33.63 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  34.44 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  34.29 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  27.71 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  27.06 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
227 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>