56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1857 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  33.12 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  37.04 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  31.87 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  24.68 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  29.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  27.95 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  35.54 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  29.61 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  28.3 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  26.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  26.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  26.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  26.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  34.33 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  32.35 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  31.43 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  29.56 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  29.56 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  32.09 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  29.05 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  29.05 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  29.05 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  30.5 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  30.22 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  29.29 
 
 
160 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  29.29 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  29.29 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  28.03 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  30.71 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  26.28 
 
 
141 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  30.15 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  30.22 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  29.5 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  30.15 
 
 
151 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  33.13 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  28.89 
 
 
133 aa  58.2  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  28.21 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  30.61 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  26.43 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.48 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  27.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  32.58 
 
 
144 aa  52  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  28.57 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  29.63 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  26.75 
 
 
149 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  25.16 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  27.94 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.05 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  28.48 
 
 
168 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>