More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1748 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  100 
 
 		 382 aa  776    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.88 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.65 
 
 		 338 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 328 aa  277  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.2 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.95 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  45.28 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  46.44 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.73 
 
 		 338 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.27 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  45.13 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  46.13 
 
 		 348 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.95 
 
 		 438 aa  262  8.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.42 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  44.06 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  43.39 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  43.53 
 
 		 337 aa  260  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.53 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.33 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  40.9 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  46.31 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  46.95 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.18 
 
 		 417 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50.17 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  44.28 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  45.7 
 
 		 370 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  47.92 
 
 		 338 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.6 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  47.67 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  47.19 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.18 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  47.19 
 
 		 354 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  45.72 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  46.73 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 338 aa  253  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  46.88 
 
 		 326 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  44.74 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  45.23 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  42.29 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  46.89 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  49.83 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  42.57 
 
 		 341 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  46.89 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  47.12 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  43.75 
 
 		 428 aa  248  9e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  46.93 
 
 		 334 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.74 
 
 		 350 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  47.12 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  42.69 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  47.73 
 
 		 358 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  42 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  45.37 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  38.66 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.15 
 
 		 435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.57 
 
 		 336 aa  246  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  43.77 
 
 		 437 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  44.31 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  43.21 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  45.19 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  44.41 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.48 
 
 		 344 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  46.2 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  45.64 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.55 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  44.98 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  46.86 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  45.92 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  48.43 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  44.98 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  45.76 
 
 		 356 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  44.72 
 
 		 440 aa  243  6e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  47.3 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  42.56 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.62 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.48 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.98 
 
 		 425 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.62 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.6 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  44.29 
 
 		 350 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.55 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  42.32 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  43.27 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.96 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  42.65 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  41.3 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  40.85 
 
 		 407 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.61 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  44.64 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  43.5 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  43.5 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>