More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1697 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  70.73 
 
 
253 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  68.02 
 
 
253 aa  367  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.35 
 
 
249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  63.82 
 
 
248 aa  332  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  61.38 
 
 
249 aa  328  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  65.04 
 
 
250 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  63.82 
 
 
250 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  317  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  64.23 
 
 
250 aa  317  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  63.82 
 
 
250 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  63.41 
 
 
250 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  63.82 
 
 
250 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  63.41 
 
 
250 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 
248 aa  315  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 
248 aa  311  9e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 
250 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 
250 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 
250 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  63.01 
 
 
250 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 
250 aa  309  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  62.2 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  62.2 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  59.35 
 
 
248 aa  308  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.96 
 
 
248 aa  307  9e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  59.02 
 
 
251 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  56.97 
 
 
293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  56.91 
 
 
248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  59.84 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  56.73 
 
 
247 aa  300  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  58.78 
 
 
247 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
267 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  59.39 
 
 
229 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 
247 aa  298  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  56.91 
 
 
248 aa  296  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  54.69 
 
 
601 aa  296  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.73 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  57.38 
 
 
270 aa  295  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 
247 aa  295  4e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  55.74 
 
 
247 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 
247 aa  294  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  55.74 
 
 
248 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  56.56 
 
 
247 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  58.44 
 
 
247 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  57.14 
 
 
247 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  55.28 
 
 
436 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  55.33 
 
 
247 aa  292  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  56.97 
 
 
248 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 
249 aa  292  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 
249 aa  291  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  56.96 
 
 
250 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 
247 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  54.92 
 
 
247 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 
247 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.02 
 
 
270 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  54.47 
 
 
249 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 
248 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.15 
 
 
247 aa  289  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 
248 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.52 
 
 
250 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
251 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
251 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  52.03 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
270 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  52.03 
 
 
249 aa  287  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
270 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
248 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  54.07 
 
 
248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  58.93 
 
 
229 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  55.95 
 
 
247 aa  280  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  56.64 
 
 
234 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  54.92 
 
 
253 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  54.1 
 
 
252 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  55.31 
 
 
234 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
245 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 
245 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 
229 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  56.14 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
245 aa  272  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>