More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1675 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  42.45 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 148 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 147 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 168 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  36.25 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 151 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  36.48 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  35 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.25 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 148 aa  98.2  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 151 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 148 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 150 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 150 aa  96.3  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  33.74 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 148 aa  95.5  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 147 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 148 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 159 aa  95.5  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 147 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  35.58 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  36.94 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 150 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  29.17 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  32.47 
 
 		 153 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 151 aa  92  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 149 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  30.3 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  33.12 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.18 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  35.95 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  30.3 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.48 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  34.01 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  34 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 147 aa  89  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 146 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  30.57 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  33.75 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  32.7 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 146 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 148 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  33.55 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 149 aa  85.9  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  33.1 
 
 		 149 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  31.72 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  31.76 
 
 		 148 aa  85.1  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  33.12 
 
 		 157 aa  84.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  36.18 
 
 		 150 aa  84.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 150 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 		 150 aa  84.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 		 150 aa  84.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  29.66 
 
 		 149 aa  84.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  32.89 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>