17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1664 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  701    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  25.51 
 
 		 653 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  28.42 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  25.56 
 
 		 1795 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 		 1505 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  27.06 
 
 		 2344 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1121 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  23.87 
 
 		 5743 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.63 
 
 		 1332 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  20.95 
 
 		 1428 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  23.53 
 
 		 3325 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  26.89 
 
 		 1141 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1457 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  25.38 
 
 		 2704 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  25.27 
 
 		 1424 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1657 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  22.99 
 
 		 2839 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>