More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1652 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1652  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 555 aa  1118    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000177723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2086  ABC transporter related  24.82 
 
 		 592 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2437  ABC transporter related  26.53 
 
 		 604 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000799452 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5763  ABC transporter related  25.86 
 
 		 632 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  22.64 
 
 		 572 aa  126  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.84 
 
 		 1001 aa  120  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 712 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 712 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  25.75 
 
 		 726 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 712 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.5 
 
 		 1003 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.59 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  26.02 
 
 		 600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  27.35 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  24.28 
 
 		 594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  25.59 
 
 		 737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  24.95 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  23.11 
 
 		 613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.66 
 
 		 865 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.89 
 
 		 1013 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  24.78 
 
 		 577 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  24.44 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0068  ABC transporter related protein  25.93 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  23.99 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  24.19 
 
 		 699 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  24.53 
 
 		 607 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  23.46 
 
 		 583 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  23.79 
 
 		 581 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  23.94 
 
 		 583 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  23.53 
 
 		 583 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1946  transport ATP-binding protein CydD  22.89 
 
 		 574 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  23.4 
 
 		 930 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  21.85 
 
 		 663 aa  106  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  24.78 
 
 		 573 aa  106  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  22.37 
 
 		 715 aa  106  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  25.22 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  27.95 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.29 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.29 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  23.67 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  23.69 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.72 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.54 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  25.23 
 
 		 578 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.34 
 
 		 1016 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  22.44 
 
 		 719 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2024  transport ATP-binding protein CydD  24.5 
 
 		 574 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.605538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  24.12 
 
 		 574 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  22.3 
 
 		 976 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  23.87 
 
 		 725 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  23.72 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  25.05 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  23.58 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0069  ABC transporter-related protein  24.45 
 
 		 589 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.590448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  24.71 
 
 		 986 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.53 
 
 		 1012 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.61 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.08 
 
 		 971 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.27 
 
 		 1000 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0283  ABC transporter related protein  24.33 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  23.59 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  26.43 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  29.5 
 
 		 589 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  22.12 
 
 		 628 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  26.97 
 
 		 603 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  22.84 
 
 		 892 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3382  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  23.11 
 
 		 574 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000301106 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  23.78 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  22.73 
 
 		 620 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.72 
 
 		 586 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  22.75 
 
 		 712 aa  101  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  24.1 
 
 		 600 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  23.33 
 
 		 695 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.34 
 
 		 586 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  23.11 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.01 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.2 
 
 		 586 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  23.82 
 
 		 594 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.2 
 
 		 586 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  24.95 
 
 		 727 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.2 
 
 		 586 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.34 
 
 		 586 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  23.84 
 
 		 728 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  29.55 
 
 		 573 aa  100  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  25 
 
 		 704 aa  100  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.76 
 
 		 593 aa  100  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  23.19 
 
 		 606 aa  100  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0922  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.93 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000416921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  23.92 
 
 		 580 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.31 
 
 		 720 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  22.16 
 
 		 980 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.22 
 
 		 1024 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.68 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2045  transport ATP-binding protein CydD  23.84 
 
 		 574 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  25.33 
 
 		 606 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  28.74 
 
 		 571 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 728 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.2 
 
 		 548 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  34.2 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.2 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>