17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1623 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  653    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  44.89 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  43.71 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  42.72 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  41.4 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  41.29 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  39.1 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  36.1 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  37.91 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  33.72 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  37.02 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  37.02 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  43.96 
 
 		 105 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101618 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4242  hypothetical protein  33.73 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  36.49 
 
 		 345 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  55 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>