More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1598 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
502 aa  1033    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
491 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  40.17 
 
 
500 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  39.32 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  39.92 
 
 
490 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
491 aa  354  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 
474 aa  350  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 
470 aa  347  3e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  34.77 
 
 
495 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
489 aa  345  8e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.53 
 
 
479 aa  345  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
502 aa  341  1e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  35.46 
 
 
516 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  34.81 
 
 
514 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  33.67 
 
 
497 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.98 
 
 
1091 aa  329  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.33 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  35.01 
 
 
510 aa  319  7e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
481 aa  319  7.999999999999999e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  37.45 
 
 
482 aa  319  7.999999999999999e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  35.14 
 
 
537 aa  316  7e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  35.03 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
474 aa  313  4.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  35.78 
 
 
491 aa  313  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  35.97 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  31.33 
 
 
464 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  33.18 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.25 
 
 
531 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  32.49 
 
 
490 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  32.9 
 
 
490 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31.36 
 
 
498 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  31.15 
 
 
494 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  28.46 
 
 
571 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.55 
 
 
548 aa  252  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.25 
 
 
526 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.43 
 
 
568 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.8 
 
 
574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.44 
 
 
553 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  28.9 
 
 
605 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.1 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.93 
 
 
518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.43 
 
 
568 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 
568 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  27.53 
 
 
582 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 
566 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  29.65 
 
 
547 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  30.45 
 
 
566 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.52 
 
 
495 aa  236  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.53 
 
 
566 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.14 
 
 
566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 
627 aa  233  5e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  31.83 
 
 
569 aa  233  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.14 
 
 
566 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.14 
 
 
566 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  27.88 
 
 
568 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.68 
 
 
566 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  26.79 
 
 
593 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 
566 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  26.68 
 
 
568 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  28.68 
 
 
557 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  28.49 
 
 
571 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.94 
 
 
566 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  28.8 
 
 
534 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.46 
 
 
593 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 
566 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.29 
 
 
530 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.49 
 
 
564 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.61 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  28.05 
 
 
581 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.63 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.73 
 
 
576 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.73 
 
 
562 aa  219  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  26.43 
 
 
512 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.5 
 
 
573 aa  218  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  28.66 
 
 
510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  27.61 
 
 
541 aa  217  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  28.54 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.05 
 
 
568 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.31 
 
 
469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  28.16 
 
 
581 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  27.1 
 
 
574 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  28.46 
 
 
540 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 
558 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.48 
 
 
478 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.21 
 
 
569 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.18 
 
 
477 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.32 
 
 
569 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
551 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  27.86 
 
 
481 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.93 
 
 
570 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.87 
 
 
550 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.93 
 
 
570 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
770 aa  202  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  27.16 
 
 
535 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  28.48 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  30 
 
 
483 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.04 
 
 
558 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>