132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1578 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  35.56 
 
 
166 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.96 
 
 
178 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  28.72 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.84 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  39.08 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.44 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.08 
 
 
169 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.04 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.93 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  29.35 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.49 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.75 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  27.6 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  28.11 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  27.46 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  27.51 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  28.42 
 
 
183 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.57 
 
 
164 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  28.49 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  28.49 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  28.49 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  28.49 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  28.49 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  27.51 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  27.51 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.18 
 
 
167 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  27.42 
 
 
183 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  26.2 
 
 
186 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.05 
 
 
154 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.61 
 
 
154 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  23.91 
 
 
167 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  36.49 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  36.49 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  36.49 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  26.6 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  24.73 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  23.63 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  36.49 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  23.63 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  35.14 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.05 
 
 
154 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  27.23 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.33 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.1 
 
 
180 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  33.02 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  27.81 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  28.49 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  27.92 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  29.67 
 
 
161 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.21 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  24.32 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.04 
 
 
156 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  28.32 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  40 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  26.02 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  28.34 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.48 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.48 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  28.43 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  26.84 
 
 
148 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  26.63 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  45.45 
 
 
157 aa  52.8  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  28.42 
 
 
161 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  32.14 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.94 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.26 
 
 
170 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.14 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  35.21 
 
 
160 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.04 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  25.14 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  28.49 
 
 
171 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.14 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  26.6 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  29.37 
 
 
183 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
167 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  29.24 
 
 
184 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.04 
 
 
160 aa  48.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.67 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  34.15 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.62 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  35.62 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.67 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.91 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.81 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  25.25 
 
 
636 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  37.35 
 
 
259 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.53 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>