More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1549 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  51.83 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  52.91 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  51.05 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  52.91 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  50.53 
 
 		 198 aa  211  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  51.83 
 
 		 204 aa  211  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  53.16 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  50 
 
 		 198 aa  208  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  53.23 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  49.21 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  51.85 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  52.38 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  50.79 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  51.32 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  50.26 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  48.92 
 
 		 198 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  51.58 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  49.21 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  48.15 
 
 		 200 aa  197  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 194 aa  197  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  48.17 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 197 aa  195  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  50.27 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  47.94 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  48.68 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  48.47 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  50 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 197 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  48.17 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  47.85 
 
 		 197 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.85 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  46.43 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  44.02 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  50.26 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  45.16 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 200 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 203 aa  187  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  48.15 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  45.7 
 
 		 198 aa  184  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  43.52 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  45.7 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0414  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>