72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1541 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
320 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.36 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  33.75 
 
 
320 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.68 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  32.41 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  32.3 
 
 
280 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 
285 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 
285 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  31.89 
 
 
284 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  35.49 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  34.25 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  30.42 
 
 
603 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
308 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  30.49 
 
 
607 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
309 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  30.93 
 
 
298 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  32.44 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
333 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  31.85 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  36.71 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  32.45 
 
 
275 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 
320 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  27.14 
 
 
295 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  31.45 
 
 
279 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  32.41 
 
 
305 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
276 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
322 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  29.19 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
283 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  27.95 
 
 
294 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
313 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  29.62 
 
 
301 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
284 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
302 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  27.74 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  29.72 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.58 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.31 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  22.69 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 
243 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  21 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.3 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  22.4 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.37 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  26.21 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.73 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
565 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
565 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  22.41 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  23.26 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.39 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 
235 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
559 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>