85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1505 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  36.49 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  35.25 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  33.8 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  30.14 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  35.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  32.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  33.99 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  29.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.57 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  30.07 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  32.86 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  27.1 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  27.1 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  27.03 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.53 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  31.21 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  26.45 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  32.45 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  28.86 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.52 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  27.08 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  27.4 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  27.08 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.03 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  28 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  31.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.08 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.82 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  27.66 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  31.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  24.49 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  24.49 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  25.34 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  29.93 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  26.14 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  34.34 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  27.93 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  23.81 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  26.85 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  26.95 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  26.95 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  23.81 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  30.89 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  25.69 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  28.06 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  31.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  25.64 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  24.83 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  25.36 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  29.71 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  23.24 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  24.11 
 
 		 148 aa  43.9  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  29.68 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  29.87 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  27.4 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  29.22 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  38.89 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 		 157 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  26.15 
 
 		 151 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  28.67 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  33.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  26.8 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  29.61 
 
 		 489 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  27.1 
 
 		 436 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  24.31 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.7 
 
 		 152 aa  40  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  23.13 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>