More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1360 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 434 aa  842    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.18 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  57.11 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  57.04 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  52.33 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.51 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  51.49 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.39 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  51.63 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  51.63 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.58 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  50.46 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.69 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.58 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.63 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  51.39 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.69 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  50.93 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.63 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  49.07 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.41 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.15 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.19 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.72 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.77 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  48.76 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  48.54 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.22 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.54 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  49.3 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.31 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.5 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.53 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.53 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.53 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.62 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.3 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.53 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.07 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.99 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.69 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.66 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  47.1 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.99 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.04 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.99 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.5 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.65 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  48.84 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.83 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.65 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.06 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  46.06 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  45.6 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.34 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.61 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.21 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.83 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  48.84 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.77 
 
 		 454 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  45.58 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.26 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.07 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.26 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.26 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.54 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.88 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.24 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.57 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.83 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.9 
 
 		 463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.1 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  46.88 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  45.96 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.98 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.31 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.81 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.62 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.53 
 
 		 433 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.24 
 
 		 438 aa  355  5.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  46.62 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.5 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  46.39 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  47.49 
 
 		 428 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.52 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.84 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  48.06 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  48.06 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  48.06 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  48.06 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.47 
 
 		 433 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  47.84 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  44.34 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>