More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1353 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 433 aa  858    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0743  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0542496  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  35.01 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 366 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  33.25 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  31.31 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  32.63 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.01 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 419 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  30.88 
 
 		 407 aa  195  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 378 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  30.34 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  29.8 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  30.28 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  32 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  31.51 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  32 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  31.93 
 
 		 368 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  30.79 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  32.12 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  30.84 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  32.19 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  31.92 
 
 		 386 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  31.83 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.33 
 
 		 412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  30.81 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  31.88 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  33.49 
 
 		 437 aa  180  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  34.83 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  29.37 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  31.88 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  31.44 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  31.84 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  29.63 
 
 		 366 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  30.82 
 
 		 412 aa  176  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  33.17 
 
 		 422 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.64 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  28.96 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  30.39 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  29.23 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  29.7 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  33.61 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  32.58 
 
 		 422 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  32.65 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  29.19 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  31.71 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  29.79 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.6 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  30.61 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  30.39 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  30.39 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  30.39 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  30.56 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  36.02 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  45.34 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.49 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  31.59 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  47.2 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  32.59 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  31.26 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  35.48 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  30.67 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  46.91 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  46.58 
 
 		 366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  31.12 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  29.94 
 
 		 412 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  30.39 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  29.53 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  46.58 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  46.58 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  49.07 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  45.34 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  48.7 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  44.1 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  46.58 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  43.22 
 
 		 369 aa  156  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  43.21 
 
 		 370 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  46.58 
 
 		 380 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  42.24 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>