More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1352 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  100 
 
 		 617 aa  1281    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0742  penicillin-binding protein  37.23 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  36.18 
 
 		 639 aa  361  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  35.31 
 
 		 669 aa  359  7e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 		 643 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 642 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.97 
 
 		 647 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 636 aa  336  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.67 
 
 		 640 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.39 
 
 		 645 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 		 671 aa  314  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  33.74 
 
 		 619 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 634 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 		 646 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.95 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  34.35 
 
 		 600 aa  301  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 636 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 610 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 		 574 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 		 597 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 681 aa  293  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  33.51 
 
 		 615 aa  291  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  32.41 
 
 		 801 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.22 
 
 		 646 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.59 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  32.25 
 
 		 801 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 595 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 		 600 aa  286  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 766 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 630 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 		 635 aa  283  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 		 602 aa  283  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.27 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 633 aa  281  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 		 793 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  31.66 
 
 		 755 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 		 635 aa  280  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.49 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 661 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 		 646 aa  278  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 640 aa  277  4e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  31.16 
 
 		 801 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 640 aa  276  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 658 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 		 673 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 		 646 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 		 613 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 		 618 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 		 662 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 632 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  32.03 
 
 		 655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 		 655 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 		 650 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 703 aa  270  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 		 716 aa  269  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.88 
 
 		 800 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 643 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  32.22 
 
 		 596 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 		 619 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 678 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  32.13 
 
 		 625 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 		 802 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  32.39 
 
 		 599 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.22 
 
 		 626 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 803 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.38 
 
 		 641 aa  266  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.14 
 
 		 809 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.14 
 
 		 803 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 691 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 647 aa  264  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 		 624 aa  264  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 648 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 		 802 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 		 802 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 		 802 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  31.83 
 
 		 607 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 		 802 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 		 629 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 		 629 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.85 
 
 		 629 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 612 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 634 aa  262  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 612 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 		 629 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 664 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  29.97 
 
 		 771 aa  260  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 633 aa  259  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 681 aa  259  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  32.08 
 
 		 760 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 631 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 		 756 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>