More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1279 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.69 
 
 
953 aa  653    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.59 
 
 
959 aa  721    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
766 aa  1574    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.72 
 
 
953 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.68 
 
 
953 aa  648    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.74 
 
 
973 aa  715    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.05 
 
 
985 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.27 
 
 
966 aa  635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.36 
 
 
981 aa  714    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.12 
 
 
800 aa  577  1.0000000000000001e-163  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.17 
 
 
945 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.35 
 
 
962 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.43 
 
 
947 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.92 
 
 
993 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.8 
 
 
993 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.55 
 
 
995 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.12 
 
 
993 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.2 
 
 
1004 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.4 
 
 
996 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.78 
 
 
996 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  39.45 
 
 
1020 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  40.63 
 
 
996 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.85 
 
 
999 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.5 
 
 
996 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  40.2 
 
 
996 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.35 
 
 
996 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.25 
 
 
996 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.88 
 
 
989 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.52 
 
 
989 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.64 
 
 
989 aa  492  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.15 
 
 
993 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.11 
 
 
979 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.55 
 
 
979 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.03 
 
 
1007 aa  474  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.09 
 
 
1004 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.69 
 
 
982 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  38.82 
 
 
1032 aa  466  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.11 
 
 
768 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.79 
 
 
946 aa  423  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.12 
 
 
1009 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.04 
 
 
998 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.36 
 
 
759 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  32.24 
 
 
727 aa  335  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.49 
 
 
767 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 
752 aa  332  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.51 
 
 
739 aa  331  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.11 
 
 
733 aa  330  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.41 
 
 
742 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.32 
 
 
759 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.19 
 
 
733 aa  326  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.65 
 
 
746 aa  325  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.63 
 
 
759 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.11 
 
 
727 aa  323  9.000000000000001e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.59 
 
 
777 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 
764 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.03 
 
 
742 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.04 
 
 
741 aa  319  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.23 
 
 
738 aa  318  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.77 
 
 
739 aa  318  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 
739 aa  317  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.25 
 
 
767 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 
739 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 
739 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.91 
 
 
733 aa  315  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 
739 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.35 
 
 
739 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.99 
 
 
739 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.85 
 
 
739 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.85 
 
 
739 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.08 
 
 
739 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.97 
 
 
754 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.22 
 
 
739 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.6 
 
 
764 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.63 
 
 
767 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.76 
 
 
765 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.63 
 
 
769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.34 
 
 
775 aa  310  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.01 
 
 
743 aa  309  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.86 
 
 
781 aa  308  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.62 
 
 
752 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.15 
 
 
737 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.01 
 
 
751 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.03 
 
 
754 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.05 
 
 
751 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.98 
 
 
734 aa  302  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.9 
 
 
740 aa  301  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.89 
 
 
735 aa  301  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.79 
 
 
715 aa  300  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.69 
 
 
761 aa  300  7e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.52 
 
 
782 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.96 
 
 
765 aa  300  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.88 
 
 
807 aa  300  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.17 
 
 
737 aa  300  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.62 
 
 
802 aa  300  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.35 
 
 
712 aa  298  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.76 
 
 
772 aa  297  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.17 
 
 
777 aa  297  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.27 
 
 
744 aa  296  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.21 
 
 
768 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.21 
 
 
768 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>