130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1270 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  296  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  36.96 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  36.99 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  38.64 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  28.23 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.09 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  30.83 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  29.32 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  28.99 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.43 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  28.89 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  32.58 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.93 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  33.62 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  27.13 
 
 
172 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  28.68 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.11 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  32.17 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  28.37 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  31.3 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  27.21 
 
 
406 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  27.83 
 
 
206 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  28.12 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  27.61 
 
 
407 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  30.48 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  28.91 
 
 
187 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  30.22 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  29.01 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  29.66 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  28.03 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  32.41 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  26.92 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  26.15 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  27.34 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  27.27 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  27.64 
 
 
407 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.19 
 
 
406 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  26.61 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  26.56 
 
 
183 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  28.99 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.84 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  30.63 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.59 
 
 
187 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  24.81 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  24.79 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  27.69 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  26.19 
 
 
405 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25 
 
 
410 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  28.57 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  28.06 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  26.36 
 
 
189 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  25.95 
 
 
406 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  26.85 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25.78 
 
 
415 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  29.27 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  28.78 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  25.64 
 
 
409 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  28.57 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  23.81 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  27.42 
 
 
406 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  23.39 
 
 
410 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  31.09 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  27.87 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  26.24 
 
 
409 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  25 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  29.06 
 
 
411 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  27.83 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  25.95 
 
 
408 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  31.93 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  23.88 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  27.73 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.98 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  27.27 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  27.46 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  30 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  25.89 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  29.17 
 
 
185 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  35.82 
 
 
413 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  27.69 
 
 
138 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  25.98 
 
 
405 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  32.5 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  26.52 
 
 
412 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  24.79 
 
 
190 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  23.4 
 
 
418 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  26.05 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.23 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  23.48 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  42.11 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  27.87 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  26.95 
 
 
193 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  24.35 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  25.66 
 
 
248 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  28.04 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  24.06 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>