More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1260 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  100 
 
 		 522 aa  1075    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  40.77 
 
 		 595 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  37.64 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  36.82 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  36.99 
 
 		 619 aa  341  2e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  37.12 
 
 		 590 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  32.98 
 
 		 622 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 622 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  38.43 
 
 		 227 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  38.89 
 
 		 227 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  31.15 
 
 		 304 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  31.36 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  29.03 
 
 		 267 aa  115  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  31.67 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  28.96 
 
 		 383 aa  97.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  28.24 
 
 		 383 aa  93.6  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  33.33 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  26.59 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  26.59 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  36.27 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  40.66 
 
 		 253 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  40.66 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  32.2 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  24.18 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  22.85 
 
 		 307 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  51.32 
 
 		 227 aa  72  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  26.64 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  35.85 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  47.37 
 
 		 228 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  26.51 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  25.09 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  39.39 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  48.68 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  50 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  24.72 
 
 		 311 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  24.72 
 
 		 311 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  35.64 
 
 		 263 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  47.37 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  47.37 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  24.63 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  33.64 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  38.37 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  32.14 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  41.76 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  23.55 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  36.46 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  25 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  21.4 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  21.4 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.11 
 
 		 400 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  35.23 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  37.96 
 
 		 854 aa  60.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  26.77 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  36.45 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0416  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.78 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0689134  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  42.68 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  33.66 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  23.68 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  27.56 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.65 
 
 		 374 aa  60.1  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  35.51 
 
 		 224 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  43.06 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  44.16 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0343  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  48.44 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1576  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.27 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  42.67 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0493  UDP-glucose pyrophosphorylase  46.27 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  37.86 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  21.45 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  34.94 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  32.73 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.28 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.82 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.44 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  43.59 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  21.82 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.67 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.88 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  42.67 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  43.59 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  43.59 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  42.31 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>