More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1259 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  100 
 
 		 474 aa  940    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  67.3 
 
 		 472 aa  645    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  56.62 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  56.64 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2729  amino acid carrier protein  57.87 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.370789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  51.62 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  45.55 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  41.49 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  43.72 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  43.79 
 
 		 445 aa  349  6e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  43.44 
 
 		 480 aa  348  9e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  41.24 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  41.48 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  44.1 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  42.33 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  43.45 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  43.23 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  41.77 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  43.23 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  43.23 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  42.83 
 
 		 481 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  44.03 
 
 		 466 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  42.33 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  44.16 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.52 
 
 		 478 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.52 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.52 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  42.79 
 
 		 476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  42.3 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  42.79 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.52 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  42.79 
 
 		 476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  41.96 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.52 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  43.01 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  42.76 
 
 		 459 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  42.3 
 
 		 479 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  42.17 
 
 		 480 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  41.47 
 
 		 477 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  42.41 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  42.3 
 
 		 479 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  41.29 
 
 		 504 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  41.08 
 
 		 504 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  43.23 
 
 		 453 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  42.14 
 
 		 458 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  42.14 
 
 		 458 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  41.9 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  40.97 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  41.9 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  40.17 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  40.17 
 
 		 456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  43.05 
 
 		 477 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  43.05 
 
 		 477 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  43.38 
 
 		 470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  40 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  41.65 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  39.66 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  41.61 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  39.87 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  39.66 
 
 		 462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  40.22 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  39.78 
 
 		 503 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  38.72 
 
 		 489 aa  326  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  45.12 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  39.35 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  40.08 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  39.35 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  41.15 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  40 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  40 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  40.94 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  40.5 
 
 		 471 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  42.7 
 
 		 477 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  42.76 
 
 		 448 aa  322  7e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.15 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41.15 
 
 		 455 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41.15 
 
 		 455 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  38.93 
 
 		 498 aa  322  8e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  40.22 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  42.67 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  41.15 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.94 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  40.04 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  40.94 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 477 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  43.11 
 
 		 477 aa  319  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 477 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  41.01 
 
 		 485 aa  318  9e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  43.11 
 
 		 477 aa  318  9e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  42.27 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  41.65 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  42.48 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  39.74 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  38.24 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>