More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1243 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  50 
 
 
259 aa  227  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  40.95 
 
 
447 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40.25 
 
 
287 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.25 
 
 
287 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  41.29 
 
 
464 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  42.42 
 
 
420 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
417 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  42.26 
 
 
296 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  41.29 
 
 
464 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  40.08 
 
 
284 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  36.52 
 
 
454 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  40.91 
 
 
464 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  45.69 
 
 
427 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  41.52 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  40.08 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.88 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  36.09 
 
 
434 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
293 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.35 
 
 
250 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  37.11 
 
 
432 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
291 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  39.92 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.61 
 
 
435 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  37.6 
 
 
447 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  42.73 
 
 
439 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  38.16 
 
 
285 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  39.57 
 
 
421 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 
434 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 
291 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 
444 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  40.17 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.66 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  38.56 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  38.14 
 
 
431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  40.26 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
291 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  37.39 
 
 
292 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  35.97 
 
 
445 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.74 
 
 
292 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 
423 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 
286 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  39.9 
 
 
425 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1671  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
273 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.22 
 
 
465 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.14 
 
 
426 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  36.97 
 
 
421 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3980  CBS domain containing protein  38.82 
 
 
425 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3902  CBS domain containing protein  38.82 
 
 
425 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  41.55 
 
 
440 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  40.42 
 
 
439 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 
279 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  38.94 
 
 
431 aa  165  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  36.86 
 
 
442 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  35.04 
 
 
438 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  36.44 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  36.86 
 
 
424 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.98 
 
 
433 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.29 
 
 
420 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  38.2 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  35.02 
 
 
433 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  41.67 
 
 
371 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  36.12 
 
 
295 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  36.51 
 
 
425 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  35.34 
 
 
439 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.05 
 
 
430 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  39.74 
 
 
426 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  37.44 
 
 
285 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  34.48 
 
 
295 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  38.03 
 
 
296 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  39.82 
 
 
421 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  34.48 
 
 
295 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  38.75 
 
 
438 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  38.5 
 
 
447 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  38.22 
 
 
285 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  33.9 
 
 
293 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  39.82 
 
 
421 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  35.19 
 
 
279 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 
419 aa  159  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  38.17 
 
 
280 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 
279 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 
279 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  32.08 
 
 
464 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 
452 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  38.03 
 
 
297 aa  158  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  37.07 
 
 
273 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
275 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.64 
 
 
299 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  35.24 
 
 
295 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 
295 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 
295 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 
279 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>