190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1232 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1148    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  39.53 
 
 
381 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  40.45 
 
 
341 aa  196  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  42.35 
 
 
356 aa  196  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  40.73 
 
 
361 aa  190  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  37.8 
 
 
386 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  40.9 
 
 
330 aa  187  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  40.5 
 
 
370 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  42.29 
 
 
201 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  25.04 
 
 
539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  25.66 
 
 
772 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  27.57 
 
 
366 aa  98.2  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  25.51 
 
 
760 aa  93.2  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  27.15 
 
 
329 aa  88.6  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  28.37 
 
 
289 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  25.26 
 
 
226 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  26.41 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  23.85 
 
 
768 aa  80.5  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  26.39 
 
 
1196 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 
639 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 
639 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  32.5 
 
 
663 aa  78.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  26.44 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  28.09 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  25.26 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  24.56 
 
 
226 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.4 
 
 
1518 aa  75.1  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  23.78 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  32.98 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  25.17 
 
 
740 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  24.58 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  25.52 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  26.52 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  25.29 
 
 
1911 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  24.65 
 
 
226 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  26.49 
 
 
862 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  22.18 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  22.18 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  27.76 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  25.96 
 
 
287 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
620 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 
625 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  23.55 
 
 
287 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  24.22 
 
 
269 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  26.3 
 
 
276 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.24 
 
 
636 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  24.66 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  25 
 
 
654 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  28.4 
 
 
319 aa  64.7  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  25.61 
 
 
1132 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  24.22 
 
 
358 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  24.68 
 
 
538 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  27.16 
 
 
829 aa  64.3  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  23.63 
 
 
620 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.53 
 
 
892 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  24.05 
 
 
398 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  22.68 
 
 
617 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  22.26 
 
 
426 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  31.4 
 
 
301 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  26.36 
 
 
276 aa  60.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  29.85 
 
 
742 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  25.7 
 
 
223 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  24.3 
 
 
359 aa  60.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  26.55 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
637 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 
259 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  38.64 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  25.29 
 
 
660 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  21.69 
 
 
621 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 
637 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  21.65 
 
 
802 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  24.16 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.11 
 
 
554 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  25.98 
 
 
826 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  26.16 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  24.5 
 
 
398 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  30.85 
 
 
338 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  25.33 
 
 
527 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  26 
 
 
952 aa  58.9  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  24.52 
 
 
925 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  25.77 
 
 
356 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  25.52 
 
 
489 aa  57.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  25.6 
 
 
628 aa  57.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  24.83 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  22.48 
 
 
346 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26.28 
 
 
586 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  24.15 
 
 
882 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  24.25 
 
 
282 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 
358 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  22.18 
 
 
781 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  28.85 
 
 
230 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  30.88 
 
 
420 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  24.53 
 
 
522 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
349 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  24.83 
 
 
344 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  23.96 
 
 
298 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>