34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1194 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  100 
 
 		 856 aa  1675    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  27.51 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.08 
 
 		 824 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  23.76 
 
 		 949 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  23.05 
 
 		 902 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  27.41 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  23.12 
 
 		 891 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  23.05 
 
 		 938 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  26.44 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  23.57 
 
 		 957 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.02 
 
 		 573 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  24.56 
 
 		 953 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.26 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  21.41 
 
 		 573 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  25.69 
 
 		 600 aa  54.3  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  21.05 
 
 		 573 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  22.61 
 
 		 903 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.1 
 
 		 921 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  22.09 
 
 		 573 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  20.68 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  21.3 
 
 		 573 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  20.73 
 
 		 573 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1128 aa  52  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  24 
 
 		 774 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  29.24 
 
 		 1133 aa  51.2  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  27.84 
 
 		 1139 aa  51.6  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.7 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  21.67 
 
 		 973 aa  50.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  20.52 
 
 		 573 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  20.52 
 
 		 573 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1201 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  21.84 
 
 		 1312 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  23.76 
 
 		 850 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1198 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>