17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1177 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1177  flavodoxin family protein  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.392318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0589  flavodoxin family protein  50 
 
 
166 aa  168  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0527  flavodoxin family protein  40.24 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  39.41 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1764  flavodoxin family protein  38.65 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11410  hypothetical protein  31.13 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0211  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.46 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.48876e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2502  hypothetical protein  27.17 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  27.78 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  29.06 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  35.71 
 
 
215 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  23.96 
 
 
175 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  33.82 
 
 
216 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  35.82 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  26.79 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>