More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1049 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03832  translation elongation factor G1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08110)  54.31 
 
 		 799 aa  773    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  50.44 
 
 		 691 aa  656    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1049  elongation factor G  100 
 
 		 695 aa  1437    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00560945  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  49.05 
 
 		 691 aa  649    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  63.88 
 
 		 695 aa  950    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1778  translation elongation factor G  51.46 
 
 		 682 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  50 
 
 		 691 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  47.89 
 
 		 692 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  49.63 
 
 		 692 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2813  elongation factor G  64.71 
 
 		 695 aa  933    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115924  normal  0.668258 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01520  elongation factor g 1, mitochondrial precursor (mef-g-1), putative  53.27 
 
 		 811 aa  777    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1934  elongation factor G  62.52 
 
 		 693 aa  917    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.34 
 
 		 696 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  47.23 
 
 		 709 aa  641    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1583  elongation factor G  64.46 
 
 		 694 aa  940    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32800  predicted protein  59.53 
 
 		 700 aa  825    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39465  predicted protein  55.65 
 
 		 745 aa  777    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000000268657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  50 
 
 		 691 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2166  translation elongation factor G  53.39 
 
 		 710 aa  771    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  47.51 
 
 		 693 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2292  elongation factor G  64.6 
 
 		 694 aa  942    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.06 
 
 		 697 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  50 
 
 		 691 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  50.36 
 
 		 692 aa  662    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  48.1 
 
 		 691 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0550  elongation factor G  71.43 
 
 		 693 aa  1034    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.276809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  63.58 
 
 		 696 aa  955    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  49.71 
 
 		 691 aa  642    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1660  elongation factor G  64.66 
 
 		 695 aa  940    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.264114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  47.38 
 
 		 688 aa  632  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  46.63 
 
 		 691 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  48.45 
 
 		 713 aa  628  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  48.27 
 
 		 696 aa  631  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  47.51 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  47.99 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  46.63 
 
 		 691 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  47.54 
 
 		 699 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  47.97 
 
 		 698 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  47.66 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  47.17 
 
 		 692 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  46.75 
 
 		 699 aa  625  1e-178  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  47.67 
 
 		 692 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  46.9 
 
 		 699 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  47.45 
 
 		 708 aa  627  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  48.13 
 
 		 700 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.63 
 
 		 694 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  46.63 
 
 		 694 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  47.45 
 
 		 689 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  46.54 
 
 		 699 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  47.63 
 
 		 700 aa  625  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4509  elongation factor G  45.43 
 
 		 697 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  47.33 
 
 		 698 aa  622  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  45.6 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  47.03 
 
 		 708 aa  621  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  45.75 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.15 
 
 		 692 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  47.98 
 
 		 700 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  45.7 
 
 		 704 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  45.6 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  48.17 
 
 		 697 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.92 
 
 		 700 aa  621  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  47.14 
 
 		 698 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  47.56 
 
 		 704 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  47.88 
 
 		 692 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  46.53 
 
 		 695 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  47.56 
 
 		 702 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000296872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  47.56 
 
 		 702 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000179981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  47.62 
 
 		 690 aa  617  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  47.09 
 
 		 689 aa  618  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  47.21 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  47.56 
 
 		 702 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  46.86 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  46.33 
 
 		 703 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.07 
 
 		 700 aa  616  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.15 
 
 		 690 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  45.44 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  47.74 
 
 		 692 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  46.7 
 
 		 704 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  47.14 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  46.99 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  46.76 
 
 		 704 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.15 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0663  elongation factor G  47.1 
 
 		 694 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  46.42 
 
 		 694 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  47.41 
 
 		 704 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  46.51 
 
 		 690 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  48.49 
 
 		 703 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  45.95 
 
 		 698 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  48.41 
 
 		 701 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  48.35 
 
 		 703 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0695  elongation factor G  47.1 
 
 		 694 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000135868  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  47.44 
 
 		 690 aa  612  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>