More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1040 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  48.86 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  51.69 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  45.45 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  49.44 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0195  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.10156  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  47.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 87 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0231  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0167652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>