More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1012 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.69 
 
 		 713 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  47.44 
 
 		 718 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  100 
 
 		 817 aa  1660    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  48.13 
 
 		 722 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.96 
 
 		 713 aa  644    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.75 
 
 		 713 aa  641    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  45.98 
 
 		 721 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  46.45 
 
 		 720 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  46.45 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.1 
 
 		 722 aa  624  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.1 
 
 		 722 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  46.1 
 
 		 722 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.1 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  46.1 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  46.1 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  45.82 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.59 
 
 		 712 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.38 
 
 		 722 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.54 
 
 		 722 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  45.13 
 
 		 722 aa  618  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  46.1 
 
 		 722 aa  618  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  45.56 
 
 		 722 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.14 
 
 		 722 aa  612  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  45.75 
 
 		 718 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.66 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.77 
 
 		 716 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.77 
 
 		 716 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  45.63 
 
 		 718 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  44.48 
 
 		 717 aa  593  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  46.19 
 
 		 728 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  46.24 
 
 		 721 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  43.7 
 
 		 759 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  45.55 
 
 		 760 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  43.01 
 
 		 736 aa  576  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.69 
 
 		 724 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.43 
 
 		 726 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.98 
 
 		 761 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 716 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  44.78 
 
 		 718 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  44.38 
 
 		 727 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  44.54 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.81 
 
 		 757 aa  568  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  44.12 
 
 		 730 aa  567  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  44.54 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  43.53 
 
 		 757 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.76 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  45.34 
 
 		 713 aa  557  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.31 
 
 		 754 aa  554  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.19 
 
 		 723 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  43.86 
 
 		 762 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 710 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  43.85 
 
 		 754 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  44.95 
 
 		 801 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  42 
 
 		 719 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  42.12 
 
 		 762 aa  545  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  43.83 
 
 		 713 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  42.78 
 
 		 721 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  42.94 
 
 		 705 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  42.78 
 
 		 699 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  41.03 
 
 		 763 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  44.21 
 
 		 756 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.76 
 
 		 759 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  40.68 
 
 		 778 aa  529  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  43.45 
 
 		 775 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  42.49 
 
 		 707 aa  529  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  41.09 
 
 		 773 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  41.84 
 
 		 720 aa  525  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  41.91 
 
 		 710 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  41.03 
 
 		 719 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  40.38 
 
 		 773 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  40.6 
 
 		 766 aa  522  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  41.36 
 
 		 773 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  41.04 
 
 		 784 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.5 
 
 		 773 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.2 
 
 		 786 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  40.58 
 
 		 767 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  41.57 
 
 		 772 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  40.92 
 
 		 767 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  42.61 
 
 		 789 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  41.36 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.66 
 
 		 776 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  41.09 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  41.36 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  41.36 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  41.57 
 
 		 773 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  41.14 
 
 		 777 aa  512  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  42.2 
 
 		 789 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  41.06 
 
 		 802 aa  512  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  40.96 
 
 		 774 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 740 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  41.41 
 
 		 775 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  40.76 
 
 		 787 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.08 
 
 		 787 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  41.22 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.89 
 
 		 788 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.54 
 
 		 774 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  40.94 
 
 		 776 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  41.37 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  40.85 
 
 		 776 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  40.84 
 
 		 781 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>