More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1007 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  65.15 
 
 
265 aa  362  4e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  62.88 
 
 
264 aa  348  6e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.55 
 
 
262 aa  291  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  53.41 
 
 
262 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  52.27 
 
 
262 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.92 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  52.27 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.55 
 
 
261 aa  272  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.52 
 
 
262 aa  271  9e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  51.89 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.83 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.06 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  51.14 
 
 
262 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  53.79 
 
 
261 aa  261  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.56 
 
 
260 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  51.95 
 
 
260 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  52.27 
 
 
262 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  51.17 
 
 
260 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.56 
 
 
260 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.14 
 
 
261 aa  257  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  51.52 
 
 
262 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  49.05 
 
 
262 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  49.24 
 
 
262 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  49.05 
 
 
262 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.39 
 
 
260 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.39 
 
 
260 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.95 
 
 
263 aa  254  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.38 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  48.29 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  49.03 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  48.29 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  50.58 
 
 
261 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  49.22 
 
 
262 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  51.89 
 
 
260 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  48.29 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  48.29 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  49.22 
 
 
260 aa  251  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  49.61 
 
 
261 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  51.52 
 
 
261 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
260 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
260 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  52.27 
 
 
260 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
260 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
260 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
260 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
260 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
260 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  47.91 
 
 
262 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
260 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  51.52 
 
 
260 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
261 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
260 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  47.66 
 
 
260 aa  248  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  47.66 
 
 
260 aa  248  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
261 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.48 
 
 
261 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
261 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  48.05 
 
 
260 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
261 aa  244  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.53 
 
 
261 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.61 
 
 
260 aa  244  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.3 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  48.83 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.83 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  48.3 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  50.39 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  49.05 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.83 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.83 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  48.3 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  49.24 
 
 
266 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  48.3 
 
 
263 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.24 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  49.22 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.24 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  48.25 
 
 
260 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.44 
 
 
261 aa  242  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
262 aa  242  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  48.05 
 
 
261 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.44 
 
 
260 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  49.25 
 
 
264 aa  241  9e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>