More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0977 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  781    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  66.67 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  65.68 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  57.84 
 
 
356 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  59.29 
 
 
370 aa  345  8.999999999999999e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  58.81 
 
 
330 aa  334  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  58.82 
 
 
341 aa  325  8.000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  64.36 
 
 
201 aa  234  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  38.05 
 
 
559 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  37.82 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  33.92 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  30.97 
 
 
663 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  32.75 
 
 
772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  42.14 
 
 
715 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  35.5 
 
 
760 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  32.76 
 
 
224 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  42.14 
 
 
263 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  32.26 
 
 
768 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  28.81 
 
 
310 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  31.23 
 
 
289 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 
223 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  31.32 
 
 
539 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  28.93 
 
 
226 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.65 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.87 
 
 
826 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  31.47 
 
 
245 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  28.93 
 
 
226 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.41 
 
 
586 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  27.5 
 
 
214 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  29.36 
 
 
226 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 
829 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  38.89 
 
 
282 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  32.69 
 
 
279 aa  89.7  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  27.36 
 
 
298 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.28 
 
 
267 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  37.42 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  27.73 
 
 
225 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  29.8 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  33.55 
 
 
922 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  28.92 
 
 
319 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  31.31 
 
 
233 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  34.87 
 
 
446 aa  86.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  31.78 
 
 
230 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  31.78 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  38.61 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  29.43 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.6 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  37.35 
 
 
1581 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.53 
 
 
742 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  32.74 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.67 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.07 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.24 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.85 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.85 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  31.74 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  32.34 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.94 
 
 
475 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 
740 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.95 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  30.37 
 
 
237 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
952 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  37.58 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  37.18 
 
 
587 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  38.28 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  38.71 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.88 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  33.33 
 
 
1911 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.4 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.66 
 
 
554 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  36.42 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  29.41 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  34.32 
 
 
1064 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  30.67 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  31.63 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  33.57 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  40.15 
 
 
636 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  33.75 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  33.9 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  35.19 
 
 
1186 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  36.36 
 
 
751 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  35.81 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  33.74 
 
 
1196 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  29.96 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  26.47 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  34.18 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  34.22 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.94 
 
 
1104 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  34.22 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>