More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0933 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  100 
 
 		 397 aa  811    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  65.57 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  60.86 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  61.36 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  62.97 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  61.71 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  61.36 
 
 		 398 aa  521  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  66.08 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  60.71 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  59.45 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  61.36 
 
 		 395 aa  511  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  60.2 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  61.06 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  59.09 
 
 		 398 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  59.19 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  60.35 
 
 		 405 aa  504  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  60.5 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  60.75 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  57.83 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  58.48 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  58.84 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  57.39 
 
 		 408 aa  485  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  57.11 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  57.43 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  58.65 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  58.15 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  55.61 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  56.71 
 
 		 404 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  57.29 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  55.33 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  54.57 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  54.31 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  54.57 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  56.53 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  54.06 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  53.81 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  53.81 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  54.06 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  54.06 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  53.81 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  54.06 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  54.75 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  53.38 
 
 		 421 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  54.52 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  55.39 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  53.13 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  53.02 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  56.22 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  53.42 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  53.42 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  53.83 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  52.88 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  55.19 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  51.9 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  51.28 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  50.88 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  52.38 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  52.99 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  50.75 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  51.81 
 
 		 418 aa  421  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  51 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  50.5 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  51 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  52.38 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  50.75 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  51.75 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  50.38 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  50.38 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  50.38 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  50.38 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  50.38 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  49.64 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  48.88 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  49.25 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  48.27 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  50.87 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  49.87 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  48.49 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  50.51 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  49.75 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  48.99 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  50.25 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  49.12 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  49.75 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  49.38 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  48.99 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  48.61 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  48.49 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  48.76 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  48.51 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  47.97 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  49.75 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  49.49 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  49.49 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  47.85 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  49.51 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  50 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  49.75 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  48.74 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  49.24 
 
 		 413 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>