More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0893 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
343 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  46.08 
 
 
324 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
333 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  38.91 
 
 
328 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
338 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  40.66 
 
 
329 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  39.1 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  39.51 
 
 
325 aa  258  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  38.81 
 
 
326 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  38.48 
 
 
330 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.58 
 
 
332 aa  256  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
326 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  40.12 
 
 
331 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  38.81 
 
 
329 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  36.42 
 
 
337 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  41.83 
 
 
324 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  36.14 
 
 
334 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  36.14 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  39.45 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  35.65 
 
 
332 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  38.32 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  36.98 
 
 
326 aa  242  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  48.07 
 
 
329 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  38.79 
 
 
329 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  35.84 
 
 
334 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  35.91 
 
 
337 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  36.01 
 
 
337 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  36.01 
 
 
337 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
337 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  46.41 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  39.33 
 
 
331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  43.09 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  37.76 
 
 
334 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
322 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  39.69 
 
 
324 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  42.32 
 
 
328 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  35.24 
 
 
335 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  36.04 
 
 
332 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  46.81 
 
 
329 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  37.73 
 
 
323 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  35.74 
 
 
332 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  42.55 
 
 
331 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  37.2 
 
 
324 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  34.73 
 
 
336 aa  222  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  33.53 
 
 
333 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  32.52 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  31.25 
 
 
331 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  36.78 
 
 
328 aa  208  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  41.13 
 
 
265 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  31.29 
 
 
333 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
261 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  33.23 
 
 
330 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  33.03 
 
 
324 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  32.23 
 
 
328 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  32.64 
 
 
342 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  34.14 
 
 
324 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  31.63 
 
 
320 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  36.02 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  29.13 
 
 
323 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  33.23 
 
 
317 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  35 
 
 
292 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  29.25 
 
 
330 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  34.04 
 
 
339 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
321 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  28.96 
 
 
324 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  31.44 
 
 
318 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  30.42 
 
 
342 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  27.41 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  27.41 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  28.57 
 
 
341 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
314 aa  172  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
314 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  36.23 
 
 
302 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  30.3 
 
 
326 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
329 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  30.59 
 
 
262 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  32.34 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
541 aa  134  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  36.89 
 
 
269 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  30.84 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  27.33 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.88 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  30.19 
 
 
245 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  34.39 
 
 
270 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  28.1 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
330 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  31.98 
 
 
247 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>