More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0868 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  100 
 
 
335 aa  684    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.1 
 
 
329 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.59 
 
 
330 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.14 
 
 
331 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1893  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.99 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  36.5 
 
 
685 aa  208  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.28 
 
 
654 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.29 
 
 
357 aa  206  4e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.63 
 
 
376 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  38.1 
 
 
637 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  36.04 
 
 
650 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.03 
 
 
340 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  34.58 
 
 
377 aa  195  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.14 
 
 
646 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.1 
 
 
370 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.1 
 
 
370 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.01 
 
 
372 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  34.5 
 
 
340 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.74 
 
 
662 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.89 
 
 
334 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12610  NADH:flavin oxidoreductase  33.14 
 
 
368 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2106  NADPH dehydrogenase NamA  36.56 
 
 
345 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  35.09 
 
 
340 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  32.65 
 
 
370 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.47 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0271468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  37.61 
 
 
345 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  37.61 
 
 
345 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.62 
 
 
652 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  37.31 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1660  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.86 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0130759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786429  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  37.01 
 
 
345 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  37.05 
 
 
345 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.06 
 
 
366 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.27 
 
 
364 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  31.5 
 
 
365 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.95 
 
 
355 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.15 
 
 
374 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  37.24 
 
 
345 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.93 
 
 
386 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1888  NADPH dehydrogenase NamA  35.44 
 
 
345 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0520303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  35.44 
 
 
345 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.64 
 
 
668 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  34.49 
 
 
365 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.55 
 
 
644 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  35.44 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.76 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.57 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.91 
 
 
368 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084765  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  34.29 
 
 
363 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.62 
 
 
368 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.805138  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.81 
 
 
360 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  30.29 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1814  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.91 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284682  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2537  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.62 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.693892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.63 
 
 
774 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.21 
 
 
370 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  34.2 
 
 
365 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.58 
 
 
369 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.72 
 
 
361 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.14 
 
 
356 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.92 
 
 
370 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
368 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  33.05 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.82 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1022  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.86 
 
 
645 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
365 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.57 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.86 
 
 
362 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.5 
 
 
370 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.64 
 
 
555 aa  179  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.496877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.01 
 
 
369 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.73 
 
 
682 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1392  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.73 
 
 
347 aa  178  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  33.92 
 
 
360 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.5 
 
 
370 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.5 
 
 
370 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1514  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.57 
 
 
645 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1529  NADPH dehydrogenase NamA  35.74 
 
 
346 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
371 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.73 
 
 
646 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.03 
 
 
370 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.68 
 
 
374 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  31.61 
 
 
389 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1736  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.48 
 
 
369 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.01 
 
 
363 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.24 
 
 
364 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.44 
 
 
937 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.22 
 
 
387 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.01 
 
 
363 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.8 
 
 
711 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.03 
 
 
370 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
369 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.069385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.02 
 
 
791 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
364 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.73 
 
 
653 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.73 
 
 
612 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4093  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.17 
 
 
369 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4273  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.17 
 
 
369 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  31.73 
 
 
363 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>