More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0853 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  59.5 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  52.85 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 180 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0501  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  52.03 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 188 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 134 aa  130  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  52.85 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>