More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0833 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  100 
 
 
341 aa  700    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  65.56 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  68.17 
 
 
370 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  63.27 
 
 
361 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  61.08 
 
 
330 aa  350  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  61.86 
 
 
386 aa  339  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  60.49 
 
 
381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  66.67 
 
 
201 aa  229  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  40.28 
 
 
559 aa  196  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  35.97 
 
 
366 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  38.91 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  33.58 
 
 
663 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  34.94 
 
 
772 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  35.06 
 
 
760 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 
289 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  31.07 
 
 
310 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  31.82 
 
 
539 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  31.91 
 
 
282 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  30.86 
 
 
225 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  31.64 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  33.09 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  29.3 
 
 
226 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
715 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  30.08 
 
 
225 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  32.28 
 
 
768 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  33.09 
 
 
276 aa  96.7  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  31.25 
 
 
224 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  29.41 
 
 
226 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  28.62 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  37.58 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  28.79 
 
 
226 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  33.98 
 
 
270 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  28.12 
 
 
214 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 
223 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.96 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 
267 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  31.46 
 
 
269 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  34.95 
 
 
233 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  38.22 
 
 
1581 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  40.69 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.67 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 
517 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.01 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  33.19 
 
 
668 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  38.26 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.75 
 
 
826 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  33.69 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  27.63 
 
 
829 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  30.99 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  37.84 
 
 
587 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  41.13 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
740 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  25.94 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  37.34 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.53 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.91 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.53 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  26.13 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.54 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  25.93 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  27.59 
 
 
287 aa  77  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25.34 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  32.3 
 
 
287 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.88 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.12 
 
 
742 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  35.06 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.07 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.57 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.69 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  30.52 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  30.95 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27.86 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  27.8 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  24.53 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  27.92 
 
 
390 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  26.69 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.5 
 
 
751 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30.6 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  26.42 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  28.17 
 
 
1132 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  27.52 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.07 
 
 
1104 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  34.42 
 
 
922 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  27.2 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  31.25 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  29.55 
 
 
584 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  31.25 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.07 
 
 
952 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  26.55 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.73 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>