251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0788 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  74.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 		 41 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3971  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 46 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2148  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0657747  normal  0.398863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0510  50S ribosomal protein L36  80.56 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000396935  unclonable  4.5390900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000000809318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000256453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000041135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000628641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000290625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000370464  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 41 aa  58.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 48 aa  58.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2610  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142007  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3503  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000992018  hitchhiker  0.0000000744799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 		 39 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4669  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000672096  unclonable  0.00000000651208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0234  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000243083  unclonable  0.00000771527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0219  LSU ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 41 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0337  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2351  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0252  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3738  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000224875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0217  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000098301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0220  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000362841  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0215  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000134125  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0220  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000946708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4035  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000035995  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4149  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0179  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1394  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0956  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0169  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000409443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf415  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3305  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>