More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0786 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  51.32 
 
 		 152 aa  146  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  55.07 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  54.29 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  56.72 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  54.35 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52.9 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  51.45 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  55.15 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  127  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.49 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  50.7 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  52.21 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  51.56 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  43.87 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  48.92 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  48.92 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.08 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0508  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  48.91 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  48.91 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  47.18 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  47.41 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  49.64 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  50.79 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  48.28 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  52.05 
 
 		 210 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.86 
 
 		 146 aa  119  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.86 
 
 		 146 aa  119  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  48.55 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.82 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  48.15 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  52.94 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48.89 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  49.29 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  51.94 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  47.86 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 243 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  50.78 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  53.6 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  49.28 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  49.18 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  50.7 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 162 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  46.43 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  53.24 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  44.83 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  47.86 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  46.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  50 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  43.36 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  45 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  52.52 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  48.23 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  44.68 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  46.43 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>