213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0785 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
61 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
62 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
60 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
60 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 
62 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  55 
 
 
60 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  48.33 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  46.67 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  54 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  49.18 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  51.72 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  48.28 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  50 
 
 
62 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  44.83 
 
 
63 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 
60 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 
59 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  47.37 
 
 
60 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  43.33 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  36.21 
 
 
58 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  46.55 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  44.83 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 
60 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
58 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  42.11 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  41.07 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  40.98 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  42.62 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  44.83 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  42.86 
 
 
59 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  43.55 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 
60 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  43.1 
 
 
60 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  41.38 
 
 
60 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  41.38 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  37.29 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  43.86 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  43.86 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>