More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0770 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 276 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 274 aa  338  5e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0492  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.966251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 275 aa  334  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  58.67 
 
 		 287 aa  331  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  331  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 275 aa  329  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 275 aa  329  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 274 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.76 
 
 		 276 aa  323  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  57.2 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 		 280 aa  322  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 277 aa  321  7e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 		 275 aa  321  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 277 aa  321  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 287 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 275 aa  321  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 277 aa  321  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 287 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 		 279 aa  318  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 277 aa  318  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 276 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 276 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  57.56 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  57.56 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 		 277 aa  317  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  58.3 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 277 aa  315  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  57.78 
 
 		 287 aa  315  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  56.88 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  56.88 
 
 		 276 aa  314  8e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 275 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  57.62 
 
 		 287 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  56.46 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  56.16 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  311  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 		 277 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 274 aa  308  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 275 aa  308  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  57.71 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>