More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0705 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  52.05 
 
 
312 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  50.5 
 
 
310 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  50.88 
 
 
333 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  53.56 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  48.33 
 
 
311 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  48.33 
 
 
311 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 
336 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  48.44 
 
 
309 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  49.65 
 
 
336 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.28 
 
 
311 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.5 
 
 
311 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.6 
 
 
311 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  47.4 
 
 
310 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  44.63 
 
 
308 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  49.3 
 
 
336 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  48.44 
 
 
309 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.6 
 
 
311 aa  295  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  47.06 
 
 
314 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.28 
 
 
311 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.24 
 
 
310 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  47.4 
 
 
315 aa  291  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  48.95 
 
 
317 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  48.7 
 
 
303 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  45.78 
 
 
311 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  45.45 
 
 
311 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  45.45 
 
 
311 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  45.45 
 
 
311 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  47.32 
 
 
310 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.48 
 
 
303 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  47.84 
 
 
311 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  45.45 
 
 
311 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  47.84 
 
 
311 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  47.84 
 
 
311 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.78 
 
 
315 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  50 
 
 
310 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  49.64 
 
 
315 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.49 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  48.96 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.88 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  48.96 
 
 
308 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.41 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.41 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.64 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  48.43 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  48.08 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.28 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  47.95 
 
 
314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  48.44 
 
 
303 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  50 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  47.49 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.36 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  47.06 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.53 
 
 
309 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  48.55 
 
 
312 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  48.55 
 
 
312 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  48.55 
 
 
312 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  48.55 
 
 
312 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  48.04 
 
 
312 aa  279  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.96 
 
 
305 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  48.77 
 
 
305 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.71 
 
 
304 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.6 
 
 
310 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  49.12 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  46.45 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.12 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  46.15 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  46.74 
 
 
312 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  46.67 
 
 
367 aa  271  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.57 
 
 
316 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  46.21 
 
 
312 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  46.21 
 
 
312 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  48.85 
 
 
312 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  50.19 
 
 
309 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  48.5 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  48.56 
 
 
318 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  43.4 
 
 
427 aa  237  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  41.22 
 
 
321 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  41.22 
 
 
321 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.16 
 
 
325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  41.18 
 
 
324 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  44.04 
 
 
406 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  39.21 
 
 
369 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  39.35 
 
 
369 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  40.73 
 
 
311 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  42.74 
 
 
429 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.71 
 
 
321 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.41 
 
 
359 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  40.73 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  40.73 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  37.45 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  39.92 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  40.32 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>