299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0682 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  48.86 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  45.54 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  41.9 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  48.19 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  46.99 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  44.58 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 91 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  51.25 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  36.13 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  38.32 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  42.55 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  45.33 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  36.56 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  42.67 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.56 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.56 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0145  protein translocase subunit yajC  40.59 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0155516  hitchhiker  0.00195414 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  45.57 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  35.78 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  38.37 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2441  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.12 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  34.12 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  36.56 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  39.08 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  36.63 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  37.21 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  39.33 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  39.29 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  31.37 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  39.18 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  36.56 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  33.7 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36.56 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1572  preprotein translocase, YajC subunit  45.1 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  37.36 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.97 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>