More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0656 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 		 357 aa  704    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  32.42 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  38.33 
 
 		 303 aa  166  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  32.6 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  39.27 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  38.64 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  29.11 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  29.77 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  26.88 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  25.07 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  25.7 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  26.2 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  31.75 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  25.71 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  30.04 
 
 		 276 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  25.71 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  26.39 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  30.14 
 
 		 252 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  26.74 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  27.4 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  24.4 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  26.12 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 686 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 621 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 716 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1373  histidine kinase  31.19 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000714338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  26.82 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  26.82 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  26.82 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  26.25 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000343872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 867 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  25.45 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1223  histidine kinase  25.25 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0457271  hitchhiker  0.00161967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 697 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 479 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.79 
 
 		 633 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 1278 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 484 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 591 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 640 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.98 
 
 		 601 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  24.55 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  26.01 
 
 		 1337 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  25.94 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  22.98 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>