More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0621 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  916    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  35.35 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  35.06 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  38.32 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  36.45 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  32.06 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  34.15 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  33.12 
 
 		 484 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  32.52 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 449 aa  225  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  32.62 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  32.24 
 
 		 458 aa  216  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  29.57 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  28.45 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  31 
 
 		 459 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  29.48 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  27.87 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  27.98 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.74 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.44 
 
 		 469 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.38 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.98 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.98 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.98 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  27.38 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  27.21 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.57 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.79 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.79 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  26.56 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  21.81 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.3 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  22.5 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 462 aa  103  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  25.29 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>