286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0588 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
507 aa  1028    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  58.4 
 
 
508 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  56.28 
 
 
516 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  51.94 
 
 
507 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  51.6 
 
 
511 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  50.71 
 
 
509 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  50.31 
 
 
505 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
505 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  50.31 
 
 
505 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
505 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  50.62 
 
 
505 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  50.31 
 
 
505 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  50.31 
 
 
505 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  50.31 
 
 
505 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  49.9 
 
 
505 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  50.21 
 
 
505 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
506 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  50.93 
 
 
508 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  51.26 
 
 
498 aa  474  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  51.55 
 
 
504 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  50.2 
 
 
516 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  49.11 
 
 
526 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  47.51 
 
 
520 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  48.44 
 
 
504 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  48.44 
 
 
504 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  46.81 
 
 
528 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  45.92 
 
 
511 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  48.89 
 
 
506 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 
513 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  49.59 
 
 
508 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  48.5 
 
 
497 aa  430  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 
508 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  44.89 
 
 
524 aa  428  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 
508 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 
515 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 
515 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 
515 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  47.43 
 
 
499 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
506 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  46.04 
 
 
523 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
506 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  43.81 
 
 
506 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  46.88 
 
 
506 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.4 
 
 
510 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 
489 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 
505 aa  419  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  44.92 
 
 
510 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  44.94 
 
 
510 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 
538 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  42.71 
 
 
514 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.93 
 
 
513 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.72 
 
 
513 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 
513 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  42.71 
 
 
511 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.93 
 
 
513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.72 
 
 
513 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  44.33 
 
 
510 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.93 
 
 
513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.93 
 
 
513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.33 
 
 
511 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 
512 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  44.54 
 
 
510 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 
510 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  44.76 
 
 
511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  43.18 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  44.94 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0077  histidine ammonia-lyase  43.95 
 
 
510 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 
513 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  44.4 
 
 
510 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  44.63 
 
 
507 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.61 
 
 
508 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  44.19 
 
 
511 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 
510 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
513 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4085  histidine ammonia-lyase  43.54 
 
 
510 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  43.51 
 
 
510 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4137  histidine ammonia-lyase  43.95 
 
 
510 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0926785  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  45.55 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  45.55 
 
 
529 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5637  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  45.55 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  45.22 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  44.33 
 
 
511 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  46.86 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  45.26 
 
 
509 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  45.55 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  44.4 
 
 
518 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  43.27 
 
 
510 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 
529 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  41.81 
 
 
507 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  44.63 
 
 
507 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>