26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0498 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  37.38 
 
 
473 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  43.75 
 
 
461 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  41.67 
 
 
496 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  40.58 
 
 
463 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  39.13 
 
 
462 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  38.03 
 
 
463 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  36.62 
 
 
460 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  33.33 
 
 
443 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  48.33 
 
 
454 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  41.25 
 
 
456 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  31.73 
 
 
457 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  35.82 
 
 
464 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.78 
 
 
469 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  36.07 
 
 
457 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  33.85 
 
 
470 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  31.75 
 
 
472 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  35.21 
 
 
464 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.33 
 
 
509 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  30.34 
 
 
474 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  34.31 
 
 
463 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  34.72 
 
 
460 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  37.74 
 
 
469 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  30.77 
 
 
439 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  31.97 
 
 
472 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  31.58 
 
 
431 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>