16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0488 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  48.43 
 
 		 450 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  45.28 
 
 		 450 aa  147  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  46.15 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  41.48 
 
 		 450 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  40.97 
 
 		 438 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  38.93 
 
 		 1805 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  43.2 
 
 		 890 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  34.57 
 
 		 403 aa  86.3  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  34.3 
 
 		 428 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  33.71 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  35.21 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  35.42 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  34.65 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  34.65 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2689  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>