18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0460 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0460  transporter, putative  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000671937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0919  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1816  hypothetical protein  36.11 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000613029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1870  hypothetical protein  28.86 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000925185  normal  0.109413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1792  hypothetical protein  26.6 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000061096  hitchhiker  0.00339508 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1138  hypothetical protein  26.14 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000196047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1552  transporter, putative  29.75 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  28.95 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  26.51 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  26.51 
 
 		 398 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  26.51 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  26.51 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  26.51 
 
 		 413 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  26.51 
 
 		 398 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  26.51 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  20.99 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  26.51 
 
 		 413 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  38.71 
 
 		 455 aa  41.6  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>