More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0444 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  51.67 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  44.12 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  45.74 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  43.11 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.68 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  41.49 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  41.53 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  39.67 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.46 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  38.49 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.67 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  38.24 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  39.66 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.03 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.3 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  38.07 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  35.95 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  35.8 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  36.51 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  37.82 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  36.99 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  38.77 
 
 		 602 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  40.17 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  34.71 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  40.99 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  34.44 
 
 		 231 aa  152  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  40 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  36.97 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  37.76 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.85 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.42 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  45.45 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  34.78 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  32.71 
 
 		 312 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  38.05 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  37.04 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  35.68 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  33.91 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.32 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.32 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  37.33 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  31.69 
 
 		 307 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  38.86 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  35.27 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  39.15 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  36.07 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  32.59 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  32.1 
 
 		 305 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  32.1 
 
 		 305 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  32.51 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  38.86 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  38.86 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  38.86 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  38.86 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  35.91 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  35.37 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  34.65 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  33.33 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  36.49 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  36.29 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.98 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  34.92 
 
 		 259 aa  124  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  38.21 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  33.05 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  36.97 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  32.11 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  31.56 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  31.56 
 
 		 295 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  34.57 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  42.35 
 
 		 493 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  31.15 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  42.94 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  31.98 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  33.93 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  31.28 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  40.22 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  40.11 
 
 		 356 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  34.09 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  40.22 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  40.22 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  40.22 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  33.06 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  40.78 
 
 		 427 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  40.22 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  40.22 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  36.6 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  36.6 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  40.22 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  40.78 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  40.22 
 
 		 444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  29.92 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  40.57 
 
 		 479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  33.06 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  29.53 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  29.53 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>