More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0339 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  26.29 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 87 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 461 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  39.71 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  27.86 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.97 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  35.8 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.3 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>